حذّر دراسة طبية حديثة من أن التهابات المسالك البولية تؤثر في كل من الرجال والنساء، وتتسبب في خلل وظائف الكلى، الكبد، الرحم، والمثانة التي تؤدي أساساً وظيفة إزالة النفايات من الجسم.
وفي حال استمرار العدوى أو تكرارها كثيراً تؤثر عدوى المسالك البولية، بشكل خاص، على الجهاز العلوي (الكلى، الرحم، قناة فالوب) ومن ثم قدرة المرأة على الحمل.
كما يؤدي التهاب المسالك البولية لدى الذكور أيضاً إلى العقم، حيث تنتشر البكتيريا عبر غدة البروستاتا والبنية الإنجابية الأخرى التي قد تؤدي إلى انخفاض عدد الحيوانات المنوية والحركية..
كما يمكن للعدوى أن تؤثر في مواقع مثل الخصية، البربخ والغدد الجنسية لدى الذكور، وفي بعض الأحيان، قد تؤدي الحالات الصحية الأخرى؛ مثل مرض السكري إلى التهاب المسالك البولية، وقد تؤدي إلى العقم.